SOS（SIO Ocean general circulation Simulator,海洋二所海洋环流计算机）采用的是Linux高性能集群系统，即通常指的Beowulf集群。系统由32个计算节点，32个CPU，64G内存，2336G硬盘，两台交换机，千兆以太网和磁带机等构架组成。计算能力超过千亿次每秒的浮点运算。计算节点采用的是Poweredge 1850 Intel Xeon3.2GHz/1M处理器。节点间的网络连接采取以Myrinet交换机连接为主网络，另一台百兆交换机连接作后备网络的方案。

    上图是 SOS 应用的 Beowulf集群的组件视图。它揭示了Beowulf集群的组成部分。通常Beowulf集群由四个层次构成：
. 硬件：主要是指 PC服务器。
. 网络：指用于节点间通信的局域网和并行进程间通信的高速网 (Myrinet等高速网)。
. 软件：主要指 Linux操作系统和用于并行通信的并行编程库(如MPI和PVM)。
. 并行应用

    上图是 Beowulf集群的一般系统视图。无论是管理节点(Master Node)和计算节点都是PC或服务器。它们通过网络(以太网或Myrinet)相连接。所有的节点都运行Linux操作系统。运行在计算节点上的并行应用程序采用MPI进行完成并行进程间的通信。计算节点通过管理节点和外部LAN相连。整个集群系统都在一套集群管理工具监控之下。

    SOS 采用 Linux操作系统Redhat 9.0版本。使用OSCAR软件安装集群系统。并行通信软件使用 MPICH。编译工具采用MPICH中提供的C++、C、Fortran77语言编写的MPI源程序的编译和链接功能，另有PGI编译器提供的pgf77和pgf90。远程登陆工具使用SSH和VNC。

    OSCAR是构建、编制和使用 Linux 集群的一种最佳方法。它由全面集成且易于安装的软件套件组成，该软件套件专门针对高性能集群计算而设计，其中包括安装、构建、维护和使用一般尺寸Linux集群所需的一切，因此您无需下载或在集群中安装任何单独的软件包。它包括如下的元件：
. LUI：基于Linux 的无头安装应用程序 ；
. C3：集群节点管理程序 ；
. MPI/PVM：节点信息传送接口 ；
. PBS：负载管理程序 ；
. OpenSSH：安全通讯协议。

    MPICH含三层结构，最上层是MPI（Message-Passing Interface）的API，基本是点到点通信，和在点到点通信基础上构造的集群通信（Collective Communication）；中间层是ADI层（Abstract Device Interface），其中device可以简单地理解为某一种底层通信库，ADI就是对各种不同的底层通信库的不同接口的统一标准；底层是具体的底层通信库。

    SSH英文全称是Secure SHell。通过使用SSH，可以把所有传输的数据进行加密，这样“中间人”攻击方式就不可能实现了，而且也能够防止DNS和IP欺骗。SSH一个额外的好处就是传输的数据是经过压缩的，所以可以加快传输的速度。SSH有很多功能，它既可以代替telnet，又可以为ftp、pop、甚至ppp提供一个安全的“通道”。

    VNC（vitual network computing）可用于windows环境中访问linux，即在windows桌面环境使用linux的X窗口系统。并行应用程序由申请人自行寻找和安装。

    SOS使用须知：
1、用户须配备海洋二所内部局域网；
2、用户须具备一定的Linux或Unix系统操作技能；
3、每个用户有固定的硬盘空间限额，用户须合理利用硬盘空间；
4、系统限制用户的登陆IP为所内部网络IP；
5、系统限制用户在同一时间只能打开3个登陆窗口；
6、管理员应协助用户安装调试所需的并行程序及相关软件。